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NFDI-InfraTalk: "Data quality in the NFDI. Can there be a common basis?", Carsten O. Schmidt

Montag, 7.2.2022, 16:00 bis 17:00 Uhr

Publikation "Semantic Metadata Annotation Services in the Biomedical Domain — A Literature Review"

Autor:innen: Julia Sasse, Johannes Darms, Juliane Fluck | Erschienen in: Applied Sciences. 2022; 12(2):796.

Automatische Bildanalyse von Thorax-CTs von Covid-19 Patient:innen

Das entwickelte Bildanalyse-Werkzeug annotiert vollautomatisch Thorax-CTs von Covid-19 Patient:innen. Die Lungen, die Lungenlappen und die für COVID-19 typischen pathologischen Veränderungen in der Lunge werden segmentiert und das Volumen berechnet. Der CORADS-Score und der Severity Score zeigen die Wahrscheinlichkeit für COVID-19 und den Schweregrad der Krankheit an. Zudem bewertet eine Bildqualitätsanalyse, ob die Qualität des Bilddatensatzes ausreichend ist für die angebotenen Methoden.

Auf https://grand-challenge.org/reader-studies/satori-nfdi4health-test/ gibt es eine Demonstration des Bildanalyse-Werkzeugs mit einem Datensatz. Interessierte Nutzer:innen haben die Möglichkeit diese Bildanalyse mit eigenen CT-Studien-Datensätzen zu nutzen, um diese auszuwerten.

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NFDI4Health as demonstrator in the BMBF project FAIR Data Spaces

The National Research Data Infrastructure for Personal Health Data (NFDI4Health) is partner of the FAIR Data Spaces project.

Publikation "Evaluating Suitability of SNOMED CT in Structured Searches for COVID-19 Studies."

Autor:innen: Carina Nina Vorisek, Sophie Anne Ines Klopfenstein, Julian Sass, Moritz Lehne, Carsten Oliver Schmidt, Sylvia Thun | Erschienen in: Stud Health Technol Inform. 2021 May 27;281:88-92.

DOI: 10.3233/SHTI210126

Publikation "COVID-19 preVIEW: Semantic Search to Explore COVID-19 Research Preprints."

Autor:innen: Lisa Langnickel, Roman Baum, Johannes Darms, Sumit Madan, Juliane Fluck | Erschienen in: Stud Health Technol Inform. 2021 May 27;281:78-82.

Publikation "NFDI4Health Task Force COVID-19. Facilitating Study and Item Level Browsing for Clinical and Epidemiological COVID-19 Studies."

Autor:innen: Carsten Oliver Schmidt, Johannes Darms, Aliaksandra Shutsko, Matthias Löbe, Rajini Nagrani, Bastian Seifert, Birte Lindstädt, Martin Golebiewski, Sofiya Koleva, Theresa Bender, Christian Robert Bauer, Ulrich Sax, Xiaoming Hu, Michael Lieser, Vivien Junker, Sophie Klopfenstein, Atinkut Zeleke, Dagmar Waltemath, Iris Pigeot, Juliane Fluck, NFDI4Health Task Force COVID-19 | Erschienen in: Stud Health Technol Inform. 2021 May 27;281:794-798.

PMID: 34042687

DOI: 10.3233/SHTI210284